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南京农业大学发表SWEET蛋白研究进展
　　SWEET 是新发现的一类糖运输蛋白，广泛存在于真核单细胞生物、高等植物以及动物中. 它们在生殖发育、植物与微生物的相互作用、植物的逆境反应及衰老等许多方面起重要作用。近期南京农业大学的研究人员发表评述文章，概述了真核生物及原核生物中(Semi)SWEET 蛋白的研究进展和蛋白结构与功能的相互关系, 同时对 SWEET 研究中存在的问题和可能的解决途径提出了探讨和展望。
　　从环境中获取能源物质是异养生物生存的必要条件. 大多数异养生物依靠糖类提供的能量完成生长发育和繁殖过程. 因此, 细胞膜上糖类运输无论对单细胞生物还是动、 植物等多细胞生物都是十分重要的生理活动. 长期以来的研究表明, 细胞膜上存在不同种类的糖运输蛋白, 它们的功能和作用方式也各不相同。
　　2010 年, Chen 等人运用荧光共振能量转移传感器技术(fluorescence resonance energy transfer, FRET sensor)从拟南芥(Arabidopsis thaliana)中鉴定出一类新的运输葡萄糖和其他寡糖的SWEET(sugars will eventually be exported transporters)蛋白, 他们随后的研究显示, SWEET 参与植物光合产物的运输和分配过程. 最近, 在原核生物中也发现 SWEET 的同源蛋白 SemiSWEET 有类似的糖运输功能. 尽管对 SWEET 蛋白开展研究的时间不长, 但现有的结果已经显示它们在细胞与环境或细胞与 细胞之间的糖类运输过程中有重要作用. 因此深入、全面了解它们的功能有助于理解生命活动的详细过程。
　　这篇文章概述了真核生物及原核生物中(Semi)SWEET 蛋白的研究进展和蛋白结构与功能的相互关系, 同时对 SWEET 研究中存在的问题和可能的解决途径提出了探讨和展望。
　　SWEET 是一类新鉴定的、广泛存在于不同类型真核生物中的糖运输蛋白. 在结构上它们具有7次跨膜α-螺旋(transmembrane helix, TMH), 由2个3 TMH的MtN3 motif和位于其中起连接作用的一个TMH形成3-1-3的结构. 由于MtN3 motif与另一个膜蛋白家族(PF04193)成员的脯氨酸-谷氨酰氨环(PQ-loop)motif 在氨基酸序列上十分接近, 因此一些研究者将它们统称为 MtN3/PQ-loop/SWEET 蛋白.
　　SWEET广泛存在于真核单细胞生物、高等植物以及动物中. 它们在生殖发育、植物与微生物的相互作用、植物的逆境反应及衰老等许多方面起重要作用. 最近的研究显示, 原核生物中存在与真核生物SWEET类似的、 只含有一个 3次跨膜?-螺旋的蛋白, 这些蛋白属于 MtN3或 PQ-Loop家族. 从慢生根瘤菌中克隆的 SWEET同源蛋白 BjSemiSWEET1和已经鉴定的部分真核生物SWEET蛋白一样具有运输蔗糖的能力, 这个结果与其他相关研究一起暗示真核生物7次跨膜α-螺旋的糖或氨基酸运输蛋白可能由原核生物中 3 次跨膜α-螺旋的小分子蛋白通过复制或横向基因转移融合进化而来, 并且它们在行使功能时可能形成和其他许多膜转运蛋白相似的、具有 12 次跨膜结构的功能单位. 对 SWEET 的研究将为揭示多种生命现象提供重要线索.
　　文章指出，目前对 SWEET 蛋白的研究才刚开始, 但其重要性已经显现. 而动物细胞(包括人)含有 SWEET 数量相对较少, 而且相关研究报道也非常有限, 但其重要性不容忽视. 例如, 人类细胞中唯一的 SWEET 蛋白HsSWEET 具有运输葡萄糖的能力, 它可能在肝脏对血糖浓度控制以及小肠对糖的吸收上发挥重要作用, 所以弄清人以及动物体内 SWEET 蛋白的生理功能同样值得期待.
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······基因组蛋白质组与生物信息学报首批在线预发表文章上线----中国科学院
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基因组蛋白质组与生物信息学报首批在线预发表文章上线
文章来源：北京基因组研究所
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近日，由中国科学院北京基因组研究所主办的全英文学术期刊——《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics, GPB），首批在线预发表（Article-in-Press）文章成功上线。此次该刊物在线预发表功能的开通与使用，对于帮助科研人员及时发表自己的最新研究成果，使读者快速了解国内外的最新研究进展，以及提升GPB期刊的影响力都将起到积极作用。
自2003年创刊的近十年来，GBP一直遵循传统按期发表文章的出版模式，但随着人们对信息时效性的需求日益增长，为了缩短文章的发表周期，改善按期出版期刊的滞后性，从2012年6月开始，GPB将所有经过同行评议被接受的稿件，在ScienceDirect数据库中率先以在线预发表的形式提前发表，让文章更早地与读者见面，供大家阅读、引用。本期首批预发表的7篇文章，大家可通过以下介绍先睹为快：
1.本刊主编于军研究员就其十五年来关于基因组转录方面的研究成果发表了简短评论，对一些问题进行了更深入的思考，并对一些传统观点提出了新的挑战。
2.全基因组序列分析是生物信息学和计算生物学研究的基础，Bilal Wajid等人对过去数十年Genome Assembler的研究工作进行了总结，对二代测序技术的一般算法特点进行了综述，为初学者和感兴趣人员了解本领域提供了很好的帮助。
3.在于军研究员和胡松年研究员的指导下，崔鹏、刘万飞、赵宇慧等人对三甲基化组蛋白H3赖氨酸4（H3K4me3）进行了研究。他们通过比较小鼠大脑和睾丸组织中H3K4me3、H3K27me3的基因组图谱，发现该基因修饰与组织特异性表达、功能和发育密切相关。
4.以上研究小组的研究还发现H3K4me3在正义基因3′端有显著富集，被称为3′-H3K4me3，3′-H3K4me3区域可能是作为反义转录的潜在启动子而发挥作用，而这一现象可能在真核生物中普遍存在。
5.小麦白粉病是由于感染白粉病菌引起的，可导致小麦减产。本刊编委王向峰老师与中国农业大学孙其信、解超杰老师等人合作，对两种不同基因型（易感、抗病）小麦在白粉病菌感染前后的叶片进行了转录组比较研究。结果表明，抗白粉病是一种由大量基因参与调控的极度复杂的系统反应。
6.水牛是一种重要家畜，但其全基因组序列信息尚需完善。Subhash J. Jakhesara等人利用水牛肌肉组织来源的cDNA作探针，从其基因组中捕获Tissue Specific Temporal外显子并进行454测序，以揭示该物种的肌肉组织特异性基因和单核苷酸多态性，为研究尚未完成全基因组测序物种的编码序列变异情况，提供了新的策略。
7.非编码RNA（ncRNA）在转录水平调节基因表达方面起重要作用，但仍有许多ncRNA还有待进一步被发现。Michael Bao等人研发了一种基于ab initio的寻找基因组序列中ncRNA的新方法——ncRNAscout。与传统方法相比，该方法由于加入了最小自由能t-scores和SVP值这两个参数，因此能更精确地定位基因组中的ncRNA序列。该工具可在使用。&注：如您想阅读文章全文，请登陆GPB期刊预发表文章原文链接：.
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ANSYS如何输出高品质的图形
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发表文章或者写论文时调用ansys结果的后处理
& & 对体和面来说，ANSYS默认的结果输出格式是云图格式，而这种彩色云图打印为黑白图像时对比很不明显，无法表达清楚，这对于发表文章来说是非常不便的。发文章所用的结果图最好是等值线图，并且最好是黑白的等值线图。笔者原来进行这项工作时一般借用photoshop等第三方软件，很麻烦，并且效果不好。现通过摸索，发现通过灵活运用ansys本身也能实现这项功能。现将步骤写给大家，感谢simwe对我的帮助。
（1）将要输出的结果调出，这时为彩色云图；
（2）将云图转换为等值线图的形式
GUI：plotCtrls—&Device Options—&[/DEVI]中的vector mode 选为on
命令：/DEVICE,VECTOR,1
这时结果为彩色等值线，若直接输出，打印为黑白图像时仍然不清晰，为此需进行以下几步将图像转换为黑白形式；
（3） 将背景变为白色
命令：jpgprf,500,100,1
& && &/rep
（4）对等值线中的等值线符号（图中为A,B,C等）的疏密进行调整
& && &GUI：plotCtrls—&Style—&Contours—& Contours Labeling 在Key Vector mode contour label 中选中on every Nth elem，然后在N= 输入框中输入合适的数值，例如5，多试几次，直到疏密合适
& && &命令：/clabel,1,5
（5）将彩色等值线变为黑色
& && &GUI：plotCtrls—&Style—&Colors—&Contours Colors 将Items Numbered 1，Items Numbered 2等复选框中的颜色均选为黑色，图像即可变为黑白等值线图像
& && &命令：/color,cntr,whit,1 等等
（6）最后一步：出图
& && &GUI：plotCtrls—&Capture Image
希望对大家能有所帮助。
一个使生成的图片在word里面比较好看的方法：
1、Plotctrls&Redirect Plots&To png file
2、选“Force White BG and Black FG&,然后把Pixle resolution 换到1200！
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学习了，谢谢！
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