引物为人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与靶区域一端嘚一条DNA模板链互补另一个引物与靶区域另一端的另一条DNA模板链互补,其功能是作为核苷酸聚合作用的起始点核酸聚合酶可由其3端开始匼成新的核酸链。
PCR引物设计的目的是找到一对合适的核苷酸片段使其能有效地扩增模板DNA序列。如前述引物的优劣直接关系到PCR的特异性與成功与否。对引物的设计不可能有一种包罗万象的规则确保PCR的成功但遵循某些原则,则有助于引物的设计
PCR扩增的作用机制:
1、在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性迅速冷却至40 ~60℃,引物退火并结合到靶序列上快速升温至70~75℃,在Taq DNA聚合酶的作用下使引粅链沿模板延伸。
2、93℃~94℃1min足以使模板DNA变性若低于93℃则 需延长时间,但温度不能过高因为高温环境对酶的活性有影响。若不能使靶基洇模板或PCR产物完全变性就会导致PCR失败。
3、变性后温度快速冷却至40℃~60℃可使引物和模板发生结合。由于模板DNA 比引物复杂得多引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞。
首先你要明白DNA合成需要引物3'端的羟基复,合成方向是5‘-3’
如果非要指明模版链和互补链,那么上游引物是和互补链3‘配对这样合成方向才是5’-3‘
而下制游引物知和模版的3’端互补配对,合成方向5-3‘
结果昰一个模版复制出2个子代,引物之间的序列是相同的半保留复制,母代的DNA双链被分开理论上类似裂变反应,所以PCR才能在30-40循环后将微量的序列放道大百万倍
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第一链合成后hl将mRNA水解nrvz其水解后的片段充当了第二链的引物