跑rna电泳条带分析时loading buffer的条带都没有是什么原因

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即送15丁当
电泳不出结果,连loading buffer也跑不出来,都停在加样孔中
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这个帖子发布于12年零7天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
在别人的胶上和他们的产物同时跑电泳也是一样,高手指点一下吧。难道RT-PCR用的试剂会对溴芬兰发生反应吗?
不知道邀请谁?试试他们
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重新做吧,原因不好说。肯定是什么地方出错了,BPB是不会和RT试剂反应的,要找出原因还不如重新来过。
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肯定是胶的问题,建议重新制胶再作。
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郁闷啦,又做不出来,已经知道胶和TBE都没有错(用以前的PCR结果都可以跑出来),加样孔周围似乎有淡淡的产物,溴芬兰好像往阴极走了一些。在线等高手的指教
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丁香园中级站友
:):)&在别人的胶上和他们的产物同时跑电泳也是一样?&啥意思?和人家同跑,人家能跑出来?你不能?如果是这样,你自己都知道是啥原因,你除了PCR 引物和标本和别人不一样,你和别人都一样,如果和你的师兄试剂盒都一样,你所做的就是排除你的PCR 引物和标本.;);)RT-PCR用的试剂对溴芬兰一般不会发生反应,不知道你是用PCR后的产物跑电泳的还是用连接好的质粒DNA分子跑的,我所知道的如果你用后者的产物跑的,你的质粒提取的后部分,就是用乙醇洗脱的时候,一定要把乙醇洗脱干净,如果不干净,加样时你的溴芬兰就会很快跑掉,效果就会不好.
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yangyang73 edited on
就是别人的能跑出来,而我的不行。引物和反应试剂与以前一样,以前电泳都正常。将以前的产物与现在的产物一起跑电泳,以前的也正常,单独跑溴芬兰也正常。现在可以肯定的是溴芬兰、胶和电泳液都没问题,问题肯定是产物上或试剂,可想不同是什么原因,可以造成这种现象、请高手指点准备明日换用别人的试剂再试试。郁闷!
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这种现象在我们实验室也出现过,当日是RT-PCR,结果产物只停留在点样口附近,但只是少数情况.后来我们问了一下宝生物,他们说也经常遇到,称为"挂口现象".但是什么原因我们也没弄清楚.
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企盼更多高手指点,现在我们的实验简直处于近乎停顿的状态啦,怎么办啊?
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是不是电泳仪的问题啊?检查一下接口
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你们检查一下电泳用的梳子是不是弄毛了.
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电泳仪应该没有问题的,因为和别人的产物一起跑电泳别人就能跑出来。TBE、琼脂糖胶、电泳仪这些外部条件都一样的,就是产物不同,今天上午又拿质粒DNA做了PCR,然后电泳,还上面一样。电泳不出结果,连loading buffer也跑不出来,都停在加样孔中
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遇到这种情况,最好从头再来,很难说是什么原因。
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今天重新配的TBE,换用别人的PCR试剂重新做还是一样啊。现在已知:TBE、胶、试剂、PCR仪、电泳槽电泳仪都没有问题。
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怎么办啊?
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建议你用别人的质粒DNA和引物自己做一下,看看能不能做出正确的结果。如果能做出来,才能证明问题出在你的质粒DNA或引物上。我怀疑可能是你操作中有什么地方没注意到。自己同时做一下别人的和自己的东西试一试。
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我前不久看师兄做实验也出现这种问题,他重新做了一次,用同样的材料设备却能跑出来.原因他也不知道.所以你最好重新再试试.
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今天我跑垂直板也出现这种情况!我换了一次TBE,稍微好一点!但是别人认为并不是TBE用的太久
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另外,这两天老是烧胶,但是电泳时间并不是很长,不知为什么?
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DNA电泳10来分钟,loading buffer中的溴酚蓝就不在了,照相却发现什么东西都没有?同一块胶,同样的电泳缓冲液,上午用着挺好,下午就这样了~~~
该用户从未签到
生物秀版主
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就是说你的胶用了两次?中间间隔了几个小时?
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恩,到了一块18个孔的胶,没有用完,就接着用了,我们一直都这样做的,请问这样有什么不好吗?
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同一块胶?难道你用一块胶跑两次电泳?你胶里面的离子都跑完了,不能跑第二次的。
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生物秀版主
楼上说的即是。再者,照相的时候,胶里的EB效果也在不断消失,你可以尝试把胶再染一下看看。
胶其实可以反复用,但是最好是再溶,然后再加EB使用。
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生物秀举人
换下TAE 或者TBE,胶可以反复用,这个是偷懒的方法,经过实践检验,可用,但奉劝你最好是一次性应用
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定期换TAE吧,每次配少量的凝胶,用完之后在配制
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生物秀举人
电极没接反?
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假如你配胶多了的话,可以用多少就切出来,剩下的,可以用一次性手套装着放到四度冰箱,没有关系的,还有用过的胶也也可以回收,用来做检测,这样就可以节省资源,用的时候一定要多加一点缓冲液,重新溶解,而且时间长一点,这样效果还是挺好的。我觉得你说的loading buffer不见了,会不会是因为点样的时候把孔弄穿了,还有就是你的DNA会不会还有酒精残留,这样的话,loading buffer也会流失掉的。希望我的意见对你有点启发!愿你实验成功!
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生物秀举人
同意楼上的,要注意电极,酒精残留,孔是否完整。
另,你的胶是否很薄,经常制胶的同学们会发现,其实加样孔的高度要比胶面高出一些,你看到样品已经加到孔中,可在电泳的过程中,因为胶面要低得多,所以大多样品在平行的运动中已经散出胶面。
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murongxiaoxiao大叔级摄影爱好者,喜欢分享绝对零度积极有责任心,热心公益事业yiii红米达人,爱拍照的北京女孩跑琼脂糖凝胶电泳的时候loading buffer 没跑出去是什么原因
生曰快樂_0418
以平板电泳为例,不知你指的是从上下垂直表面跑出去还是指水平跑出去呢?
如果是水平方向的话,那是因为跑的时间没有足够久,一般我们都不会跑那么久让他跑出去的,那样不只浪费时间还影响实验。
如果你是指上下垂直表面的话:是因为跑电泳时候是在一个水平的电场中进行的,电源正负两极之间的电场也是水平方向而不是弯曲的,loading buffer混合的样品中的电子当然也是顺着电场的水平...
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标题: 请高手帮忙看看这张电泳图
摘要: [请高手帮忙看看这张电泳图] pET的表达质粒1ml菌液离心得到的菌加入100ulloading buffer,煮沸5min冰箱放了两三个小时才跑的电泳只是粗略12000离心了2分钟5%的浓缩胶,7 5%的分离胶,30V浓缩胶,80V分离胶,大概跑了3个小时,溴芬兰到了最底下。有dxy的朋友告诉我可能菌体太多,loading buffer不够,或者核酸太多加样时候样品有点果冻状,很难加样,容易一团地飘起。电泳结果如下图,还有几 关键词:[条带 电泳 电泳图 浓缩胶 分离胶 冰箱 菌体]……
pET的表达质粒1ml菌液离心得到的菌加入100ulloading buffer,煮沸5min冰箱放了两三个小时才跑的电泳只是粗略12000离心了2分钟5%的浓缩胶,7.5%的分离胶,30V浓缩胶,80V分离胶,大概跑了3个小时,溴芬兰到了最底下。有dxy的朋友告诉我可能菌体太多,loading buffer不够,或者核酸太多加样时候样品有点果冻状,很难加样,容易一团地飘起。电泳结果如下图,还有几个疑问首先,每个孔道都很多竖向的条带,是否是因为上扬量太大呢?其次,就像中间第五道marker,条带都是W型的弯弯曲曲,不知道什么问题第三还是marker问题。我用的是takara的宽泛marker,应该是200,116,97.2,66.4,44.3,29,20.1,14.3,6.5一共9条条带,其中66.4应该是亮带。但是电泳出来的marker似乎条带数量不足,而且条带相对位置和目录上的图不一样,亮带位置也不对,可能照片不够清楚,我把我看到的marker位置都标出了数字,能不能帮忙看看,究竟是少了哪几条?最后还有一个问题是染色和洗脱的时候,似乎胶缩水了,会是因为我的配方不对吗?多谢帮忙。
据图初步估计样品可能提得不好,一般跑起来有竖线下来的,样品没有处理好,增加离心时间,重提下看。条带不直应该是电泳液或者是胶没有配好。胶缩水可能是你的液体中甲醇浓度太高了。Mark的位置就难说了。希望对你有所帮助,祝实验顺利!
请问这个蛋白应该怎么个提法呢?我没有提纯我的目标蛋白,只是跑的细菌的全蛋白
你的PAGE胶做的不好!菌体的量我觉得还行,你可以不用调整; 你试试新的缓冲液,我觉得你的缓冲液有问题. 我不知道你的蛋白marker是否分装放在-20度的,不过Takara的Marker也一般啊.还有你下次跑全菌电泳时,Loading buffer 中DTT的量要够,煮的时间可以延长到10分钟,最高转速离心5分钟,立即上样.你目的蛋白的分子量多大啊? 为什么跑7.5%的胶啊?
我的蛋白有1200个氨基酸左右,可能有130kD以上吧蛋白marker配好以后放到四度了你说的缓冲液,是指配胶的缓冲液还是电泳缓冲液呢?
电泳缓冲液.冻存在-20度最好分装
pET的表达质粒1ml菌液离心得到的菌加入100ulloading buffer,煮沸5min冰箱放了两三个小时才跑的电泳只是粗略12000离心了2分钟5%的浓缩胶,7.5%的分离胶,30V浓缩胶,80V分离胶,大概跑了3个小时,溴芬兰到了最底下。有dxy的朋友告诉我可能菌体太多,loading buffer不够,或者核酸太多加样时候样品有点果冻状,很难加样,容易一团地飘起。电泳结果如下图,还有几个疑问首先,每个孔道都很多竖向的条带,是否是因为上扬量太大呢?其次,就像中间第五道marker,条带都是W型的弯弯曲曲,不知道什么问题第三还是marker问题。我用的是takara的宽泛marker,应该是200,116,97.2,66.4,44.3,29,20.1,14.3,6.5一共9条条带,其中66.4应该是亮带。但是电泳出来的marker似乎条带数量不足,而且条带相对位置和目录上的图不一样,亮带位置也不对,可能照片不够清楚,我把我看到的marker位置都标出了数字,能不能帮忙看看,究竟是少了哪几条?最后还有一个问题是染色和洗脱的时候,似乎胶缩水了,会是因为我的配方不对吗?多谢帮忙。加样的时候,用点温水加热一下样品,否则就会出现果冻状,特别是在冬天。因为loading buffer中的SDS很容易析出。加样量尽量要小一点,我的体会是10ul以下。所以你的样品要浓一点。marker不清楚,你可以加大一下上样量。200,116,97.2,66.4,44.3,29,20.1,14.3,6.5一共9条条带,这样的marker,最好胶的浓度大一点。你用15%试一下。条带弯曲,最有可能的就是,配胶溶液PH不对,你重新配一下。
我觉得上样时呈果冻状是核酸太多的缘故,因为我以前也遇见过。当时我在冰浴里超声后,再离心,效果就不错。超声切切要冰浴,并且要时间短,多次超,免得发热破坏蛋白。离心后沉淀要瓷实,上清不能有拉丝,就说明可以了。
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非常感谢各位,超声了以后,样品的确不粘了。我洗脱液里面掺了点水,胶后来就没缩水了,估计当初洗脱液配方不对用10%的胶再跑了一次marker,似乎条带的数目和相对位置似乎又对了,不过因为是转膜以后用丽春红染来看的,看得不太清楚,也不太确定。会不会是因为7.5%的胶太稀,会对marker有很大影响?
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