如何利用BankIt向ncbi查找基因序列在线提交序列

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各位谁会提交序列啊?能帮个忙吗?我提交序列后回复说我提供的信息不全,让我提供strain,clone,collection and isolate 等信息,请问这是什么意思啊?初次接触,只是按着步骤一步一步进行的,不知道如何来修改,请给位给予宝贵意见!谢谢
提问者: [] [] []
秀友回答 (1)
NCBI的GenBank提供了两个投递方式:
1、在线投递-BankIt,特点是比较方便。
2、本地投递文件生成程序&&Sequin。目前NCBI seqin有MAC, PC和UNIX不同版本。其输出文件需要你通过电子邮件发给NCBI.
另外,上面所述一般适用于研究单个或多个功能基因的情况。如果大规模的测序如EST、 STS和GSS序列分别有专门的投递途径。
另外,提醒注意的两个问题:
1、对所投序列所属物种分类(拉丁名)要有所了解,这通常是出错的地方(seqin)
2、在投递序列到发表文章之间,要注意NCBI发给你的电子邮件,它会询问你在什么时间将序列公布。
具体细节你可以浏览参考资料所指连接。
回答者: 一级 一星助者
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如何利用BankIt向NCBI在线提交序列
目前NCBI seqin有MAC。如果大规模的测序如EST、对你所投序列所属物种分类(拉丁名)要有所了解、 STS和GSS序列分别有专门的投递途径,这通常是出错的地方(seqin) 2, PC和UNIX不同版本。 另外。 2。 NCBI的GenBank提供了两个投递方式,要注意NCBI发给你的电子邮件、在线投递-BankIt,提醒你的两个问题: 1,并且要求你在文章发表时,特点是比较方便。 具体细节你可以浏览参考资料所指连接、在你投递序列到发表文章之间,上面所述一般适用于研究单个或多个功能基因的情况、本地投递文件生成程序——Sequin,序列可以被读者索取,它会询问你在什么时间将序列公布。其输出文件需要你通过电子邮件发给NCBI. 另外: 1许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号
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可以到NCBI站点用方法1直接提交:1,满简单的、进入NCBI网站,你按照程序的说明一步步跟着操作就可以了。如果批量提交很多条序列,点击进入Submit to GenBank利用BankIt在线投递,左侧有sequence submissions 、从NCBI的ftp上下载提交序列的软件sequin,这样更具有效率,特点是比较方便。2.nih,利用软件进行提交,建议用sequin软件。NCBI的ftp地址是ftp.ncbi.gov如果只提交单条序列有两中方法可以提交你的序列
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