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求教perl大神,如何编写程序把拟南芥数据库中水稻基因组中29个SBP转录因子基因的序列下载下来,谢谢啊
data/ftp.0/&#47.edu/version_7.all首先拿到转录因子的基因ID:&#47:&#47。然后上 msu的Rice网站 以及 拟南芥的TAIR网站 的ftp下载全体蛋白的序列;pub/annotation_dbs/version_7;all.dir&#47。具体.pseudomolecules&#47.0&#47:ftp.dir/o_sativa&#47.pep然后根据名字自己提取;&#47.edu&#47.Eukaryotic_Projects/data/o_sativa&#47.annotation_dbs&#47,你既然说是29个我想你已经拿到这29个SBP基因的名字了吧;pub/Eukaryotic_Projects/pseudomolecules&#47,这个随便什么编程语言都可以做的.pep和ftp
本人菜鸟一个,还不是太懂,能不能把具体的程序编码告诉我下,万分感激啊
如果只有29个你手工搜索也就20分钟而已,何必编程呢。记得搞个editplus或者ultraedit方便操作文本。另外我不会perl语言。
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其他1条回答
这个简单。不过 没时间做。
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