怎样看genedoc导出来的不同物种蛋白蛋白质同源性分析

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(生物化学与分子生物学专业优秀论文)油茶种子油体蛋白基因的分离克隆及其原核表达.pdf99页
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硕士论文:油茶种子油体蛋白基因的分离克隆及其原核表达 摘要 油茶是我国南方最重要的可食用木本油料树种。油茶种子油体蛋白对种子中油
脂的储藏具有重要意义。近年来随着油体表达系统研究和发展,油体蛋白基因的分
离克隆和表达的研究更是得到了广泛的重视。为了分离克隆油茶油体蛋白基因并将
之发展成―种经济简单的蛋白表达纯化体系,我们特开展了本课题的研究。主要研
究结果如下:
1 油茶种子油体蛋白的分离和鉴定 以成熟油茶种子为材料,利用油体在水相中离心漂浮特性,经反复洗涤和离心
分离提取油茶种子油体,并检测不同pH条件下油体的稳定性,结果显示,当pH
为6.2和6.8时,油体表面电荷被中和,油体间发生聚合,由此推测油茶油体等电
点约在6.5左右。对油茶油体丙酮沉淀初提物中的蛋白组分进行SDS
结果显示油茶种子中两类蛋白表达量较大,分子量约为14.4kDa和18.4kDa,与本
文中油茶油体蛋白基因ORF分析推测的蛋白大小相近。同时也发现了其他少量的
大分子量蛋白的存在,对这些蛋白的鉴定还有待进一步的研究。
2 油茶种子油体蛋白基因的分离克隆和生物信息学分析 利用EST技术、多序列比对和序列聚类等生物信息学方法分离筛选油茶种子
eDNA文库中的油体蛋白基因。分离到的油茶油体蛋白家族基因可聚为5类,分别 oleII,cooleIII,CO
命名为;COoleI 包括A和B两个亚类 、CO oleIV和∞oleV。 oleI、Co oleV
将其与其他物种油体蛋白进行比较分析,结果表明:Co oleIV和Co
据这些基因的ORF设计引物 分别含起始密码子和终止密码子 扩增了其基因组
DNA序列,eDNA序列和基因组DNA序列的比较结果表明后者均不含有内含子,
且两者也存在一定的差
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LEA 蛋白的同源性及其应用潜力
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